博茨瓦纳位于南非地台的卡拉哈迪台向斜的东南边缘。约80%的面积被卡拉哈迪系(第三纪至现代)沉积物覆盖，只有东部和西北部地区局部出露第三纪以前的基岩。全境可分为罗得西亚克拉通、卡普瓦尔克拉通和卡拉哈迪克拉通三个构造单元，前两者为古老的太古宙克拉通，后者为元古宙克拉通。

    1. 罗得西亚克拉通位于博茨瓦纳东部，主要由古太古代的超基性岩、基性岩、酸性变火山岩，以及绿片岩相和早期角闪石相的沉积变质岩、花岗岩组成。

    2. 卡普瓦尔(Kaapvaal)克拉通位于东南部，出露新太古代片麻岩、超基性岩、火山岩和花岗杂岩等岩石，绝对年龄约24亿年，为稳定的结晶地盾。

    3. 卡拉哈迪克拉通，又称年轻的克拉通(台向斜)区，它保留着未变质的元古宙和显生宙的沉积岩和火山岩，其范围包括博茨瓦纳南部和中部广大地区。由林波波活动带、元古宙地台盖层、达马腊活动带和卡鲁群盖层组成。林波波活动带位于东部地区，时代较老，遭受过强烈构造变质作用。构造变质作用主要发生在距今约27亿年前，在22?5亿～20亿年前还断续活动。出露岩石为高级变质相(晚期角闪岩相偶尔为变粒岩相)的片麻岩，以及沉积变质岩和火山岩。达马腊活动带位于西北部，时代晚得多，位于卡拉哈迪克拉通的边缘。该活动带大部分地区被卡鲁群和卡拉哈迪系覆盖。

    元古宙盖层下为古老结晶基底的太古宙变质岩、花岗岩。盖层沉积为一套产状平缓的元古宙至新生代地层。时代最老的地台盖层是文斯特多普系，时代为23亿～21亿年，由硅质火山岩、泥岩和页岩组成；往上为德兰士瓦系，下部由石英岩、硅质白云岩、层状燧石岩组成，上部为厚度达4000米的页岩系(夹石英岩和安山岩)；该系之上是沃特堡系，绝对年龄是17亿年左右，由陆相砂页岩组成。

    元古宙盖层之上被卡鲁群(早石炭晚侏罗世)覆盖，厚度大于1500米。包括三个岩组：下部德韦卡组，为底部冰碛岩和海相沉积；中部埃卡组，为含重要煤层的陆相砂页岩系；上部为斯托姆堡组，由底部红层，风成砂岩和厚玄武岩系组成。时代最新的沉积盖层是卡拉哈里系(白垩纪?现代)，由部分固结的风成砂、各种湖相、三角洲相，以及上部未固结的砂层组成，该系最大厚度100米。

    博茨瓦纳矿产资源丰富，主要矿产有金刚石、铜、镍、天然碱、金、锰、煤等。博茨瓦纳拥有丰富的金刚石资源，特别是宝石级金刚石储量巨大，居世界之首。